Głównymi celami Szkoły Głównej Mikołaja Kopernika są kształcenie nowych badaczy oraz prowadzenie badań naukowych i prac rozwojowych. Mieszcząca się w Warszawie Szkoła Główna Mikołaja Kopernika integruje działalność pięciu kolegiów: Kolegium Astronomii i Nauk Przyrodniczych w Toruniu, Kolegium Nauk Ekonomicznych i Zarządzania w Warszawie, Kolegium Filozofii i Teologii w Krakowie, Kolegium Nauk Prawnych w Lublinie oraz świeżo otwarte Kolegium Nauk Medycznych w Olsztynie. Uczelnia kształtować będzie doktorantów nauk medycznych, dzięki czemu Warmia i Mazury zyskają nie tylko lepszych specjalistów, ale przede wszystkim otwarcie nowej uczelni wpłynie na rozwój naukowy całego regionu.
